デジモンリベレイターには、ゲーム内で起きた問題を解決する
デバッグチームが存在する。

——I.D.E.Aが開発したフルダイブゲーム・デジモンリベレイター。
このゲームには、βテスト時から確認されている
〝実装されていないはずの仕様〟があった。
即ち〝カード化されていない野生のデジモン〟だ。
野生のデジモンが、なぜ存在するのか。
なぜ、彼らはゲームに様々な不具合をもたらすのか。

その問題の原因を調査・解決するため。
そして、すべてのデジモンをカード化するため。
I.D.E.Aは一部のプレイヤーを招き入れたデバッグチームを結成したのだ。
βテストからゲームに参加していたユウキは、
相棒のインプモンや
デバッグチームの仲間と共に世界の謎へと挑んでいく。

——これは〝デジモン〟と〝世界〟を解き明かす物語だ。